(5)SNPs的检测和分析易实现自动化。如应用DNA芯片技术,可实现大规模、自动化分析检测
11、简述构建遗传图谱的依据。
同源染色体减数分裂过程中会发生交换,交换的结果便使染色体上的基因发生重组,两个基因之间发生重组的频率取决于它们之间的相对距离。因此,只要准确地估计出交换值,进而确定基因在染色体上的相对位置就可绘制连锁遗传图
分子遗传图谱构建的包括哪些主要环节?
(1)选择适合绘图的分子标记,根据遗传材料之间的多态性确定亲本组合
(2)建立作图群体,即具有大量分子标记处于分离状态的分离群体或衍生系
(3)群体中不同植株或品系的标记基因型的分析
(4)利用计算机程序建立标记之间的连锁关系
13、暂时性分离群体和永久性分离群体的区别在哪里?
暂时性:回交群体、F2群体以及其衍生群体如F2:3等。
F2群体:
(1)基因型种类全面,信息量大,作图效率高
(2)群体构建比较省时,不需很长时间便可得到一个较大的群体
(3)只能使用一代
(4)远缘杂交而来的分离群体标记比例易偏离3:1,限制了群体用于作图的效果
回交群体:
(1)群体的配子类型较少,统计及作图分析较为简单
(2)提供的信息量少于F2群体
(3)不能多代使用
永久性:
重组自交系群体(RIL):由F2经多代自交一粒传(SSD)使后代基因组相对纯合的群体。其基本选择程序是:用两个品种杂交产生F1,自交得F2,从F2中随机选择数百个单株自交,每株只种一粒,直到F6~Fn代,形成数百个重组自交系。
加倍单倍体(DH)群体:
(1)DH群体相当于一个不再分离的F2群体,能够长期保存。
(2)构建DH群体需组织培养技术和染色体加倍技术
(3)当DH群体个体数偏少时,所提供的信息量常低于F2群体
14、遗传图谱上的图距能否反映基因在染色体上的实际距离?
用于分子标记遗传作图的群体有哪些类型?
暂时性分离群体和永久性分离群体
显性和共显性标记在F2群体中分离比例相同吗?为什么?
不同。显性:3:1,共显性:1:2:1
常用的植物遗传作图的应用软件有哪些?
MAPMAKEREXP、JoinMap等
常用的质量性状基因定位的主要方法有哪些?
近等基因系分析法
分离集团混合分析法:基于性状表现性的BSA法、基于标记基因型的BSA法、极端基团-隐性群法
利用近等基因系寻找质量性状的分子标记的基本策略。
比较轮回亲本、NIL及供体亲本三者的标记基因型,当NIL与供体亲本具有相同的标记基因型,但与轮回亲本的标记基因型不同时,则该标记就可能与目标基因连锁
利用分离集团混合分析法进行质量性状基因定位的原理。
(1)基于性状表现性的BSA法:在作图群体中,依据目标性状表型的相对差异,将个体或株系分成两组,DNA混合,形成相对的DNA池
(2)基于标记基因型的BSA法:利用目标基因两侧的分子标记确定群体中个体的基因型,分别选择具有相同基因型的个体构成分组。
(3)极端基团-隐性群法:①利用极端集团鉴别目标基因所在染色体区段
②用表现型为隐性的极端个体(隐性群)确定基因位点在分子标记连锁图上的位置
举例说明分离集团混合分析法进行质量性状基因定位的应用。(真的不知道答案对不对。。。)
莴苣抗霜霉病基因、水稻抗稻瘿蚊基因、水稻抗稻瘟病基因的标记与定位
数量性状有什么特点?
(1)涉及的基因数目多
(2)对环境变化敏感
(3)性状表现呈数量上的变化
(4)性状分布为连续的近似正态分布
23、QTL作图方法主要有哪些?
区间作图法、多元回归法、精确作图法
QTL定位方法:单标记分析法、区间定位法、复合区间定位法
单标记分析法的基本原理是什么?
如果某个标记与某个(些)QTL连锁,那么在杂交后代中,该标记与QTL间就会发生一定程度的共分离,于是该标记的不同基因型在(数量)性状的分布、均值和方差上将存在差异。检验这些差异就能推知该标记是否与QTL连锁。
与单标记分析法相比,区间定位法有何优点?
更加准确和有效
目前最主要的QTL定位方法是什么?
什么是LOD值?LOD值有何意义?
概念:存在QTL的概率对不存在QTL的概率之比的对数值
意义:当LOD值超过某一临界阈值时,可认为该区间存在QTL。LOD的临界值一般在2—3之间,即有QTL的似然值相当于没有QTL的似然值的100~l000倍
什么是标记辅助选择?
利用指示某种目的性状的标记作为选择标准,是一种对目标性状进行相关选择
利用分子标记辅助选择进行目标选择的可靠性取决于什么?
分子标记与目标基因间连锁的紧密程度
利用分子标记辅助选择进行背景选择的前提条件是什么?(这个答案也不太确定,在课本281页)
必须知道每条染色体的组成,就要求用来选择的标记可以覆盖整个基因组,也就是说必须有一张完整的分子标记连锁图
试述标记辅助选择的正确率与重组率的关系。
选择正确率随重组率的增加而迅速下降。或者说重组值越小,其错选率越低
相对于传统的育种选择,分子标记辅助选择有哪些优越性?
(1)克服性状表现型鉴定的困难
(2)允许早期选择
(3)有助于利用多个等位基因
(4)允许同时选择多个性状
(5)可进行性状非破坏性评价和选择
(6)可加快育种进程,提高育种效率
33、举例说明分子标记在作物遗传改良中的应用。
利用分子标记技术对亲本评价:
(1)遗传资源多样性分析:绘制品种的指纹图谱、种质资源的遗传多样性及分类研究、种质资源的创新与鉴定、绘制目标性状基因连锁标记、选择育种亲本等
(2)预测杂种优势
(3)建立品种DNA指纹:品种纯度鉴定、新品种保护
(4)挖掘野生近缘种的优良基因
利用分子标记技术开展标记辅助选择
(1)抗性的辅助选择:将IRBB21中抗病基因(抗水稻白叶枯)Xa21导入到优良恢复系明恢63
(2)农艺性状辅助选择
34、组织培养、基因工程和分子标记技术之间有何联系?如何将这些技术结合起来改良作物性状