天启八年二月三日，朱由校在工部召见了王象晋和宋应星。
朱由校坐在桌前翻看着几本书籍，看书名有《群芳谱》、《天工开物》、《农政全书》、《甘薯疏》等等。
朱由校看了一会儿，只觉一头雾水，看向一旁侍立的徐光启，道：“徐爱卿，这农事上尔等才是专家，朕不懂。”
然后又看向王象晋和宋应星：“王卿家和宋卿家这几个月都熟悉工部事务了吧？有什么苦难和疑惑尽可提出来，朕尽量为你们解决。”
王象晋是万历三十二年中进士，曾任礼部主事，是朝中老臣了，在皇帝面前没有丝毫怯场。
但宋应星只是个举人，去年十一月才听宣入工部，一直没有具体任命，皇帝只是让他把这些年来的技术研究编写成书，今天一来就要他呈上书稿，大笔一挥就命名为《天工开物》。
此时听皇帝称自己为“卿家”，那是受宠若惊，身体都不自觉有些震颤起来。
王象晋镇定自若，拱手道：“谢皇上恩典，臣已基本熟知工部运作流程，只是不知皇上具体要臣负责何种事务？”
朱由校拍拍头：
“哦！这倒是朕疏忽了。传旨，工部下新设农政局，主掌农业技术、田垄土壤技术、水利技术等有关农事实务的改进工作，任王象晋为郎中，宋应星为员外郎。”
朱由校又看着宋应星：“宋卿家家中还有位兄长也是举人吧？”
宋应星连忙拱手道：“禀皇上，家兄宋应昇。”
朱由校点点头：“行吧！任宋应昇为工部都水司主事，你们两兄弟一起为朝廷尽点力！”
“谢皇上恩典！”宋应星拜倒在地。
“免礼。”
朱由校站起身，在工部里面慢慢踱步起来。工部内大小官员心眼都提了起来，不知道皇帝想干什么。
朱由校思虑了好一阵，叹了口气道：“众卿家可知我大明现在危机重重？”
无人敢吭声。
朱由校自言自语：
“在外，有建奴夺我辽东，威逼九边，图谋中原。北方蒙元残余亦贼心不死，虎视眈眈；
在内，大明各地贪腐成风，水旱灾害四起，瘟疫肆虐，田地里颗粒无收，粮食日益减少，农民破产，百姓流离失所，陕西一带已经有暴民带头作乱，对抗朝廷。
你们以为那些暴民为何作乱？天灾人祸？还不都是活不下去了，终究是朝廷辜负了他们。”
“对外，有兵部，有大明九边将士！对内则有赖于众卿家齐心协力、团结协作了。
当前，国朝首先要解决的就是粮食问题，民以食为天，百姓吃得饱穿得暖便不会去做那乱贼烧杀抢掠。
大明人口众多，土地有限，那么只能致力于在现有耕地的基础上提高亩产了。”
“朕听闻有来自海外的土豆、甘薯、玉米等作物，亩产可达数百斤，若可在我大明各地推广开来，必然可缓解饥荒，甚至使大明百姓丰衣足食，过上幸福的日子！”
朱由校走到徐光启、王象晋、宋应星三人面前，严肃道：
“推广种植这些新作物，必先改进作物的栽种、培植技术，有一套成熟可靠的流程方法，并且朝廷可以给百姓们分发种子或者幼苗，这样才可以迅速在民间铺开，才可以在短时间内提高粮食产量，达到安抚百姓、稳定民间的目的。
现在，北直隶和山东有大量皇庄田地，农政局可自行挑选使用，有什么困难或者需求尽可向徐尚书提，徐爱卿也必须尽力支持！”
王象晋拱手道：“禀皇上，近些年来天气愈渐严寒，许多作物在北方恐怕难以存活。”
朱由校点头：“无妨，你们先在北直隶、山东一带试验改进，日后朕在南直隶一带划些土地给你们用。”
“谢皇上！”
二月六日，朱由校下旨改革工部部门架构，公布改革举措：
革除工部原下属单位，设立以下单位并明确具体权责。
设立都水司负责工部各项事务的财务预算；
虞衡司负责工部各项事务的花费核销及库房出入库管理；
节慎司负责工部的财务出纳管理；
文思院负责金银铜货币及器物的铸造；
铁器局负责除金银铜其他金属的冶炼和铸造；
军器局负责军事武器的制造与维护；
织染局负责布料的生产和织染；
水利局负责各种水利工程设施的建设和管理；
矿务局负责各种矿物的开采提炼；
道桥局负责道路桥梁的规划建设；
营缮局负责房屋、城墙等大型工程的规划建设；
马政局负责马匹牲畜的饲养和管理；
农政局负责农事管理和农业技术的改进；
竹木局负责竹木薪炭的生产运输分配；
杂造局负责其他生活用品的生产制造。
在天启六年五月六日，王恭厂大爆炸，北京西南隅被夷为平地，炸毁房屋两万多间，死伤两万余人。灾难惨状历历在目。
考虑到安全问题，工部改革前，朱由校就命令徐光启在京师外重新择址，兴建新厂房，改名为“安民厂”，把王恭厂整体搬迁过去，远离居民区。
安民厂新址位于京师西南方向的良乡县小清河旁边，占地两万三千亩，包含了火药科、铳炮科、弓弩科、甲胄科、兵杖科、鞍鞯科、杂作科等等。
现在的工部，徐光启任尚书统筹整个工部各项事务；吴淳夫任左侍郎，但朱由校严令他不得插手工部具体事务，只负责应对其他各部官员，和东林党扯皮，去户部争财政预算什么的；毕懋康任右侍郎，主管军器局，并实际负责火药科和铳炮科。
三月十日，朱由校亲临安民厂视察，工部尚书徐光启、右侍郎毕懋康、军器局郎中孙元化、铳炮科主事张焘随同。
安民厂东临小清河，防火级别最严格的火药科和铳炮科就建在小清河旁，方便随时取水。
朱由校巡视了安民厂，最后又重点巡视了火药科和铳炮科，对随同的臣子道：
“各位卿家，未来的战争必定是以火器为主导，刀枪剑戟会逐步淘汰。军器局肩上背负的就是整个大明的命运，未来大明是龟缩防守当孙子还是开疆拓土做大爷，就看尔等把火器发展到何种地步了！”
朱由校看向徐光启：
“朕已下旨许以高薪厚禄，召集天下匠人，云集京师供工部选拔聘用。人才是发展的第一动力，徐爱卿要好好珍惜利用，不要吝惜钱财，户部给的预算不够，内帑会全力支持你的。
工部全员要立志创新、锐意改进、勇于实践、敢于验证。徐爱卿拟个章程出来，针对工部各局、各科工匠的薪酬俸禄以及创新建议的嘉奖，直接呈给朕，无须经过内阁。”
“臣领旨！”
朱由校看向孙元化：
“孙卿家兼任神机营左军总兵，以后军器局新产的火器便先交由你部使用如何？”
孙元化咧嘴笑道：“臣领旨！谢陛下恩典！”
最后又对毕懋康和张焘道：
“毕卿家和张卿家是火器上的专家，要多多留意底下人的意见，集思广益，也要参考前人的成果，如万历年间中书舍人赵士桢的《神器谱》，实践出真知，多做试验，争取早日造出更先进、更可靠的火器，让我大明将士消灭外敌，保国安民呀！”
“臣领旨！”
三月十五日，朱由校下旨，太医院下设立“太医学院”。
聘任陈实功为院长，张景岳为副院长，吴又可、傅青主为教授，广招各地大夫、郎中为讲师，收授幼童幼女入学。
戊辰年医科全部进士、举人和监生调入太医院，为逐步建立大明医学体系，打造医疗系统作人才储备。
十六日，太医院下设“女医署”。魏忠贤在宫中挑选了三千名宫娥进入太医学院培训学习，成为首批“医女”，开始建立随军医疗队。
十八日，国子监下设“太学院”，太学院分“国学”和“科学”两院。
国学院教授传统的四书五经、读书认字；科学院则教授算、农、军、律等多种学科，聘任李之藻为院长，王徵为副院长，戊辰年算、农、军、律四科进士、举人、监生皆调入科学院，为逐步建立大明的科学教育体系作准备。