三年前数码宝贝的入侵，让世界各国看到了数码宝贝的威力，许多国家立即成立数码宝贝的研究所，对数码宝贝进行研究。
经过了三年的努力，不少国家的研究成果还不错，已经能够进入到数码宝贝世界，但他们的最终目的并非是统治数码宝贝世界，而通过研究数码宝贝，从而开发出新型的武器。
有些国家或许是想称霸地球，但有些国家是受到了威胁，研究数码宝贝不过是为了武装国家的军事力量，为以后的战争做准备。
毕竟以后极有可能会是数码宝贝的战争，极早一步掌握数码宝贝的科技，对自己国家也是有好处的。
“你们的幕后主使人是谁”武新上前两步，一脚踩在夜叉的胸膛上。
死亡逼近，夜叉露出了惊恐的眼神，眼前的三眼神将犹如死神一般凝视着他，让他感觉到一股寒意。
“你…你要干什么”夜叉害怕了，连说话也变得哆嗦起来。
“我话不会再说第二遍”武新面如冰霜，散发出的杀气令周围的空气都凝结成霜。
毫无疑问，夜叉若是不说出幕后指使人，武新会毫不犹豫的杀人。
“小新哥哥…”嘉儿望着武新，眼前的高大男子瞬间变得陌生。
就连其他人也开始变得不淡定，纷纷被武新这股杀气吓到了，情不自禁的后退几步。
“他…他真的要杀人吗”大辅心惊胆颤看着眼前这个男人，这是他第一次经历过这种情况，以往都是与数码宝贝作战，从未试过与人类作战，更没有想过杀人。
忽然，夜叉全身抽搐不断，电流在其身上蔓延，一股能量爆射出来，令武新大为惊恐，向后退后一步大喊“危险，大家退后。”
众人闻其声，也感到了一股能量澎湃而来，连忙后退几步。
“轰”的一声，夜叉的身体爆开了，周围满是碎肉，显得异常恐怖。
“啊…”两个女孩子连忙捂住眼睛，不忍看到这残忍血腥的一面。
“他居然自爆了”
也就啊武的内心强大一些，敢直面这血腥的场景。
现实世界中，在一个豪华的基地中，一群人正看着一个大屏幕，屏幕上正显示出武新的三眼神将。
一个魁梧男子抽着烟，身上散发出一股无形的气息，使人不敢逼近，他看着屏幕慢条斯理的说道“这个三眼神将不就是三年前出现的数码宝贝，没想到他又出现了”
“不仅如此，他居然在我们的黑暗之塔范围内进化到完全体，实在是不简单啊”身后一个男子说道。
“三年前，就是他多次拯救人类，我们也追踪过他，但对他的资料还是个迷，看来我们要多关注他才行”
“那接下来的计划是…”
他吐出了一口烟，沉思片刻数说道“这个男人很危险，极有可能影响我们的计划，把基地所有资料都毁掉，不能让他查出我们的线索”
“是，boss”
男子拿出一个遥控，按下了中间的按钮。
夜叉死后，基地开始震动，犹如地动天摇，看似就要塌了。
“走吧，这里快要爆炸了”
武新扔下一句话，就与众人离开了基地。
从这一刻开始，武新更加坚定了自己的想法，代号夜叉的男人不过是暴龙改造者组织的其中的一员而已，其幕后还有更大的组织支撑着。
武新与众人回到太一等人所在地，在这里武新见到了啊和与光子郎，经过了三年，大家都成长为16岁的少年了。
夜幕降临，大家驻起了篝火，聊着这三年来的点点滴滴。
与原着剧情不同，三年前与极恶魔王战斗，除了武新，八个被选召的孩子全部成为了英雄，在全世界都非常出名，使得他们的人生轨迹都发生了变化。
虽然他们目前都在读初中，但他们的英雄光环注定无法像普通人那样生活，光子郎因为其天才般的头脑，被夜神研究所招去做科学家，负责数码宝贝的研究工作，当然，那里对数码宝贝的研究是保护数码宝贝为主，倡导的是人类与数码宝贝和平相处。
啊和本来就长的帅气，加上光环加身，使得他在学校非常受欢迎。
八神太一与素娜则是比较平常，但也受到了不少媒体的采访。啊助开始学兽医的知识，将来他打算救治更多的数码宝贝。
不过话说回来，学兽医真的可以对数码宝贝进行治疗吗，那些钢铁体的数码宝贝怎么治，难道要学电焊？
太刀川美美因甜美的长相，被许多娱乐公司看中，签约成你偶像明星，在岛国也是小有名气。
“对了，小新，这三年来你过得怎么样啊”讲述完了大家的经历，太一迫不及待的问起武新。
“没什么，就读书啊，和普通人一样”武新无所谓的说道。
“啊…怎么可能”太一嘘了一声，明显是不相信武新的话。
上一批被选召的孩子中，就武新最为传奇，太一怎么也不会相信武新什么事也没有发生，平平常常的过了三年。
“对了光子郎，现在夜神研究所主要的研究工作是什么”武新不想在这个话题纠缠下去，就问起光子郎研究所的事。
光子郎一愣，随即说道“目前主要是研究数码宝贝的形成，以及一些对付数码宝贝的武器，防止下次数码宝贝进攻人类世界的时候，人类能够有能力阻止”
“研究成果怎么样”
光子郎摇头说道“不尽如意，仅仅只是研究出一些武器，但这些武器用来对付数码宝贝，威力还是不够”
“这个世界还有多少组织在研究数码宝贝”
光子郎又道“太多了，自从三年前数码宝贝的入侵，给人类带来了不可磨灭的伤害，也让人类意识到数码宝贝的可怕之处，所以有很多国家成就了研究小组，对数码宝贝进行了研究”
听了光子郎的话，武新再次陷入沉默，这时大辅打破了这股宁静。
“接下来我们怎么办，数码宝贝世界里还有许多黑暗之塔，他们腐蚀着周围的数码宝贝，使他们无法进化，我们要不要帮助他们”
“那好吧，明天开始，我们就将所有的黑暗之塔毁掉”
众人举起了手，一起欢呼了起来，只有武新在一旁默不作声，他在思考，未来的趋势会如何发展，以后或许又是一场硬仗